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測序?qū)嶒?yàn)流程你真的懂嘛?
  • 更新日期:2023-03-31      瀏覽次數(shù):843
    • 1、收集樣品


      2、相關(guān)試劑 總RNA提取試劑TREzol Reagent (RNA提取試劑), M-MLV(cDNA逆轉(zhuǎn)錄酶), RNA 純化試劑, RealqPCR MasterMix (熒光定量PCR預(yù)混試劑)。


      3、實(shí)驗(yàn)儀器 熒光定量PCR儀; PCR儀;低溫離心機(jī)。


      4、總RNA提取


      5、cDNA合成 在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA(1µg/µl); 2µl隨機(jī)引物(T18, 10pmol/ul);2µl 10mM dNTP mix;加水至15µl體系?;靹蚝?0℃變性RNA 5分鐘,冰上速冷1分鐘,離心將溶液收集至管底加入6µl 5×PCR buffer;1µl RNaseout;1µl M-MLV RT;加水至30µl體系。PCR儀中反應(yīng)條件設(shè)置 37℃延伸60min,70℃保溫15min終止反應(yīng)。合成好的cDNA置于 -20 ℃保存?zhèn)溆谩?/span>


      6、引物設(shè)計(jì)與thermal cycler protocol thermal cycler protocol合成


      7、實(shí)時(shí)定量PCR 按以下反應(yīng)體系進(jìn)行: 2x RealqPCR MasterMix(Modified DNA polymerase、SYBR Green I、Optimized PCR buffer、5mM MgCI2、dNTP mix including dUTP)25ul;上游引物F 1 ul,下游引物R 1 ul;cDNA template 2ul。定量PCR儀擴(kuò)增反應(yīng)條件設(shè)置:50 ℃ 2min ;95 ℃ 10min ;95℃ 15s --60 ℃ 60 s (40個(gè)循環(huán))。


      8、PCR產(chǎn)物溶解曲線分析 將所擴(kuò)增的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行溶解曲線分析,單峰溶解曲線表示擴(kuò)增產(chǎn)物單一,無非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。溶解曲線生成的反應(yīng)程序?yàn)? 95 ℃ 15s , 60 ℃ 15 s , 95 ℃ 15s。


      注意事項(xiàng):收集標(biāo)本前必須清楚要檢測的成份是否足夠穩(wěn)定,對(duì)收集后當(dāng)天進(jìn)行檢測的標(biāo)本,儲(chǔ)存在4℃?zhèn)溆?,如有特殊原因需要周期收集?biāo)本,將標(biāo)本及時(shí)分裝后放在-20℃或-70℃條件下保存。避免反復(fù)凍融,標(biāo)本2-8℃可保存48小時(shí),-20℃可保存1個(gè)月,-70度可保存6個(gè)月,部分標(biāo)本需添加抑肽酶。

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